Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zic1P46684 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms