Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms