Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VhlP40338 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VhlP40338 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VhlP40338 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VhlP40338 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VhlP40338 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VhlP40338 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VhlP40338 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VhlP40338 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VhlP40338 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VhlP40338 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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