Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd9P40240 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd9P40240 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms