Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik2P39087 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms