Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acvr1P37172 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms