Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6dP35459 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms