Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms