Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms