Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms