Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms