Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk4P30285 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms