Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif5cP28738 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif5cP28738 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms