Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-DMaP28078 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms