Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChgaP26339 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms