Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd1P25322 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms