Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms