Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tsta3P23591 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsta3P23591 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms