Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms