Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RargP18911 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RargP18911 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RargP18911 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RargP18911 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RargP18911 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RargP18911 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RargP18911 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RargP18911 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RargP18911 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RargP18911 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RargP18911 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RargP18911 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RargP18911 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RargP18911 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RargP18911 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RargP18911 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RargP18911 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RargP18911 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RargP18911 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms