Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18533 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18533 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18533 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18533 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P18533 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms