Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18532 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18532 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18532 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18532 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18532 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18532 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18532 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18532 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18532 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18532 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P18532 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18532 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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