Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtpraP18052 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms