Protein–RNA interactions for Protein: P15209

Ntrk2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk2P15209 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ntrk2P15209 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ntrk2P15209 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ntrk2P15209 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ntrk2P15209 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ntrk2P15209 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ntrk2P15209 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ntrk2P15209 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ntrk2P15209 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ntrk2P15209 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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Ntrk2P15209 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntrk2P15209 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntrk2P15209 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ntrk2P15209 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntrk2P15209 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntrk2P15209 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntrk2P15209 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntrk2P15209 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntrk2P15209 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ntrk2P15209 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms