Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-Q9P14431 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms