Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms