Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amd1P0DMN7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms