Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf2P09926 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf2P09926 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Surf2P09926 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms