Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a2P08122 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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