Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gh1P06880 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms