Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Eb1P04230 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Eb1P04230 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms