Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01735 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01735 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01735 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01735 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms