Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01678 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01678 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01678 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01678 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01678 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01678 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01678 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01678 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01678 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01678 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01678 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01678 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01678 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01678 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01678 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01678 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01678 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01678 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01678 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms