Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01636 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01636 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01636 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01636 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01636 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01636 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01636 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01636 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01636 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01636 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01636 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01636 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01636 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01636 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01636 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01636 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms