Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MscO88940 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MscO88940 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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MscO88940 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MscO88940 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MscO88940 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms