Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd160O88875 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd160O88875 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd160O88875 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd160O88875 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Cd160O88875 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Cd160O88875 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Cd160O88875 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd160O88875 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd160O88875 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd160O88875 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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