Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tom1O88746 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tom1O88746 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms