Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcn3O88705 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms