Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms