Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AvilO88398 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AvilO88398 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AvilO88398 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AvilO88398 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AvilO88398 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AvilO88398 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AvilO88398 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AvilO88398 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AvilO88398 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AvilO88398 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AvilO88398 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AvilO88398 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AvilO88398 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AvilO88398 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AvilO88398 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AvilO88398 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AvilO88398 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AvilO88398 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AvilO88398 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms