Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp4O70480 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms