Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtssO70370 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtssO70370 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtssO70370 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtssO70370 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtssO70370 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtssO70370 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtssO70370 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtssO70370 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtssO70370 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms