Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chrna4O70174 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrna4O70174 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms