Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp2a2O55143 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms