Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nipsnap1O55125 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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