Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrxO55103 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrxO55103 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrxO55103 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrxO55103 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrxO55103 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrxO55103 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrxO55103 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrxO55103 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrxO55103 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrxO55103 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrxO55103 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrxO55103 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrxO55103 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrxO55103 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrxO55103 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrxO55103 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrxO55103 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrxO55103 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrxO55103 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrxO55103 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PrxO55103 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrxO55103 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrxO55103 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrxO55103 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PrxO55103 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrxO55103 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrxO55103 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrxO55103 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrxO55103 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrxO55103 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrxO55103 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrxO55103 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrxO55103 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrxO55103 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrxO55103 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrxO55103 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms