Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngr1O55100 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms