Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc3O55013 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3O55013 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms