Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnk2O54967 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms