Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn5O54942 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms